Aunque los beneficios de los bancos privados de cordón umbilical son muchos, también tienen algunos inconvenientes.

Listado de desventajas de los bancos privados de cordón

El primero, el precio. Almacenar las células madre de la sangre del cordón umbilical en un banco privado de cordón umbilical cuesta bastante dinero. Dependiendo del banco o de la oferta en cuestión, el precio por conservar la sangre del cordón umbilical suele rondar los 1.500 - 2.000 €, a los que algunos bancos de cordón le suman, además, una cuota anual. Donar la sangre a un banco de cordón umbilical público, por el contrario, se hace de forma altruista, sin tener que gastar dinero.

Por otra parte, el uso de las células madre de la sangre del cordón en el propio paciente (uso autólogo), es bastante improbable, por lo que la utilidad en estos casos de las muestras almacenadas en un banco privado de cordón umbilical no es muy alta. Por ejemplo, si se sufre un trastorno hematológico (en la sangre) o un trastorno genético que necesita ser tratado, el donante (el bebé , en este caso) no podría utilizar su propia sangre para someterse al tratamiento, ya que el propio trastorno se encuentra presente en las células madre donadas.